首尔市发布了“首尔市传染病应对综合措施”，涵盖综合改善公共保健医疗基础设施和服务的五大领域20个课题，其中包括改善在应对MERS过程中出现的传染病应对局限性的内容。

首先，首尔市将大量扩充负压隔离病房数量。2018年，市立医院负压隔离病房将增加5倍以上，达到6家医院194间病房。MERS扩散的主要原因是急诊人口过于密集，与呼吸道患者长时间呆在同一空间。为解决这些问题，截至2017年，东部医院、西南医院等4家市立医院急诊将安装负压设施。

为了减少以探病为目的到医院后与确诊患者接触感染的病例，到2017年为止，将有7家医院引进“单独会见室”和“医院进出管理系统”。

同时，首尔市于2015年11月19日发行了“首尔市MERS预防措施白皮书”，其中有MERS疫情发生时，每天的主要情况和疫情应对措施等详细内容。